我国在2001年发布了《可用于保健食品的益生菌菌种名单》以及《可用于保健食品的真菌菌种名单》，名单包括两歧双歧杆菌(Bifidobacterium bifidum)、婴儿双歧杆菌(Bifidobacterium infantis)等10个菌种。
我国还先后于2010年和2011年发布《可用于食品的菌种名单》和《可用于婴幼儿食品的菌种名单》，并在随后几年以公告形式对名单进行了增补。
截止2019年6月，可用于食品的菌种名单中包括了35个种或亚种。
1可用于食品的菌种名单
《卫生部办公厅关于印发<可用于食品的菌种名单>的通知》（卫办监督发〔2010〕65号）
序 | 名称 | 拉丁学名 |
第一类 | 双歧杆菌属 | Bifidobacterium |
1.1 | 青春双歧杆菌 | Bifidobacterium adolescentis |
1.2 | 动物双歧杆菌（乳双歧杆菌） | Bifidobacterium animalis（Bifidobacterium lactis） |
1.3 | 两歧双歧杆菌 | Bifidobacterium bifidum |
1.4 | 短双歧杆菌 | Bifidobacterium breve |
1.5 | 婴儿双歧杆菌 | Bifidobacterium infantis |
1.6 | 长双歧杆菌 | Bifidobacterium longum |
第二类 | 乳杆菌属 | Lactobacillus |
2.1 | 嗜酸乳杆菌 | Lactobacillus acidophilus |
2.2 | 干酪乳杆菌 | Lactobacillus casei |
2.3 | 卷曲乳杆菌 | Lactobacillus crispatus |
2.4 | 德氏乳杆菌保加利亚亚种（保加利亚乳杆菌） | Lactobacillus delbrueckii subsp.Bulgaricus（Lactobacillus bulgaricus ） |
2.5 | 德氏乳杆菌乳亚种 | Lactobacillus delbrueckii subsp.lactis |
2.6 | 发酵乳杆菌 | Lactobacillus fermentium |
2.7 | 格氏乳杆菌 | Lactobacillus gasseri |
2.8 | 瑞士乳杆菌 | Lactobacillus helveticus |
2.9 | 约氏乳杆菌 | Lactobacillus johnsonii |
2.10 | 副干酪乳杆菌 | Lactobacillus paracasei |
2.11 | 植物乳杆菌 | Lactobacillus plantarum |
2.12 | 罗伊氏乳杆菌 | Lactobacillus reuteri |
2.13 | 鼠李糖乳杆菌 | Lactobacillus rhamnosus |
2.14 | 唾液乳杆菌 | Lactobacillus salivarius |
2.15 | 清酒乳杆菌【1】 | Lactobacillus sakei |
2.16 | 弯曲乳杆菌【2】 | Lactobacillus curvatus |
第三类 | 链球菌属 | Streptococcus |
3.1 | 嗜热链球菌 | Streptococcus thermophilus |
第四类 | 乳球菌属 | Lactococcus |
4.1 | 乳酸乳球菌乳酸亚种【3】 | Lactococcus Lactis subsp.lactis |
4.2 | 乳酸乳球菌乳脂亚种【3】 | Lactococcus Lactis subsp.cremoris |
4.3 | 乳酸乳球菌双乙酰亚种【3】 | Lactococcus Lactis subsp.diacetylactis |
第五类 | 明串球菌属 | Leuconostoc |
5.1 | 肠膜明串珠菌肠膜亚种【4】 | Leuconostoc mesenteroides subsp.mesenteroides |
第六类 | 丙酸杆菌属 | Propionibacterium |
6.1 | 费氏丙酸杆菌谢氏亚种【5】 | Propionibacterium freudenreichii subsp. Shermanii |
6.2 | 产丙酸丙酸杆菌【2】 | Propionibacterium acidipropionici |
第七类 | 片球菌属 | Pediococcus |
7.1 | 乳酸片球菌【6】 | Pediococcus acidilactici |
7.2 | 戊糖片球菌【6】 | Pediococcus pentosaceus |
第八类 | 葡萄球菌属 | Staphylococcus |
8.1 | 小牛葡萄球菌【7】 | Staphylococcus vitulinus |
8.2 | 木糖葡萄球菌【7】 | Staphylococcus xylosus |
8.3 | 肉葡萄球菌【7】 | Staphylococcus carnosus |
第九类 | 芽孢杆菌属 | Bacillus |
9.1 | 凝结芽孢杆菌【8】 | Bacillus coagulans |
第十类 | 克鲁维酵母属 | Kluyveromyces |
10.1 | 马克思克鲁维酵母【9】 | Kluyveromyces marxianus |
注：1.传统上用于食品生产加工的菌种允许继续使用。名单以外的、新菌种按照《新食品原料申报与受理规定》执行。2.可用于婴幼儿食品的菌种按现行规定执行，名单另行制定。 | ||
【1】《关于批准番茄籽油等9中新食品原料的公告》（2014年第20号） 【2】《关于弯曲乳杆菌等24中“三新食品”的公告》（2019年第2号） 【3】《关于批准翅果油等2种新资源食品的公告》（2011年第1号） 【4】《关于将肠膜明串珠菌肠膜亚种列入<可用于食品的菌种名单>的公告》（2012年第8号） 【5】《关于批准雨生红球藻等新资源食品的公告》（2010年第17号） 【6】《关于批准壳寡糖等6种新食品原料的公告》（2014年第6号） 【7】《关于小牛葡萄球菌等3菌种的公告》（2016年第4号） 【8】《关于发酵乳杆菌CECT5716等3个菌种的公告》（2016年第6号） 【9】《关于批准显齿蛇葡萄叶等3种新食品原料的公告》（2013年第16号） | ||
2可用于婴幼儿食品的菌种名单
《关于公布可用于婴幼儿食品的菌种名单的公告》（2011年 第25号）
菌属 | 名称 | 拉丁名 |
双歧杆菌属 Bifidobacterium | 动物双歧杆菌Bb-12 | Bifidobacterium animalis Bb-12 |
乳双歧杆菌HN019或Bi-07 | Bifidobacterium lactis HN019 or Bi-07 | |
短双歧杆菌M-16V【1】 | Bifidobacterium breve M-16V | |
乳杆菌属Lactobacillus | *嗜酸乳杆菌NCFM | Lactobacillus acidophilus NCFM |
鼠李糖乳杆菌LGG或HN001 | Lactobacillus rhamnosus LGG or HN001 | |
发酵乳杆菌CECT5716【1】 | Lactobacillus fermentum CECT5716 | |
罗伊氏乳杆菌DSM17938【2】 | Lactobacillus reuteri DSM17938 | |
【1】《关于发酵乳杆菌CECT5716等3个菌种的公告》（2016年第6号） 【2】《关于批准塔格糖等6种新食品原料的公告》（2014年第10号） *仅限用于1岁以上幼儿的食品 | ||
3可用于保健食品的益生菌菌种名单
《关于印发真菌类和益生菌类保健食品评审规定的通知》（卫法监发[2001]84号）
序 | 名称 | 拉丁学名 |
第一类 | 双歧杆菌属 | Bifidobacterium |
1.1 | 两歧双歧杆菌 | Bifidobacterium bifidum |
1.2 | 婴儿双歧杆菌 | Bifidobacterium infantis |
1.3 | 长双歧杆菌 | Bifidobacterium longum |
1.4 | 短双歧杆菌 | Bifidobacterium breve |
1.5 | 青春双歧杆菌 | Bifidobacterium adolescentis |
第二类 | 乳杆菌属 | Lactobacillus |
2.1 | 德氏乳杆菌保加利亚种 | Lactobacillus bulgaricus subsp.bulgaricus |
2.2 | 嗜酸乳杆菌 | Lactobacillus acidophilus |
2.3 | 干酪乳杆菌干酪亚种 | Lactobacillus casei subsp. casei |
2.4 | 罗伊氏乳杆菌 | Lactobacillus reuteri |
第三类 | 链球菌属 | Streptococcus |
3.1 | 嗜热链球菌 | Streptococcus thermophilus |
4可用于保健食品的真菌菌种名单
《关于印发真菌类和益生菌类保健食品评审规定的通知》（卫法监发[2001]84号）
序 | 名称 | 拉丁名 |
1 | 酿酒酵母 | Saccharomyces cerevisiae |
2 | 产朊假丝酵母 | Cadida atilis |
3 | 乳酸克鲁维酵母 | Kluyveromyces lactis |
4 | 卡氏酵母 | Saccharomyces carlsbergensis |
5 | 蝠蛾拟青霉 | Paecilomyces hepiali Chen et Dai, sp. nov |
6 | 蝙蝠蛾被毛孢 | Hirsutella hepiali Chen et Shen |
7 | 灵芝 | Ganoderma lucidum |
8 | 紫芝 | Ganoderma sinensis |
9 | 松杉灵芝 | Ganoderma tsugae |
10 | 红曲霉 | Monacus anka |
11 | 紫红曲霉 | Monacus purpureus |
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